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整理:體外診斷網(wǎng)
來源:綜合IVD學習筆記、 IVD資訊 、各公司官網(wǎng)
2020年12月31日晚,WHO正式通報了新冠病毒自出現(xiàn)以來的主要變異情況,包括四種變體。其中提到,2020年12月14日,英國向世衛(wèi)組織報告了一種被命名為B.1.1.7的新冠病毒變體。
《科學》雜志稱,其傳播能力要比原始毒株高70%左右!而倫敦最近新冠感染病例超過60%都來自變異病毒!該病毒株最大特點是出現(xiàn)了十幾個關鍵位點的變異,尤其在S蛋白上,帶來的實際后果就是它的傳播力更強,病毒蛋白的結構發(fā)生改變后跟我們?nèi)梭w當中的ACE2受體更容易結合,進而導致傳播能力增強。隨后,國內(nèi)開始出現(xiàn)攜帶該毒株的境外輸入病例。2021年1月2日,廣東省疾控中心在一名英國輸入新冠肺炎確認病例的咽拭子樣本中發(fā)現(xiàn)了B.1.1.7突變株,與近期英國報道的變異病毒基因序列高度相似。1月6日晚,河北邢臺市召開新冠肺炎疫情防控新聞發(fā)布會,河北邢臺新冠病毒基因測序結果公布:與歐洲輸入病毒高度同源。快速對新冠病毒突變株B.1.1.7作出鑒定也成為了目前疫情防控的關鍵之一,鑒別診斷刻不容緩。至少12家企業(yè)推出了13款產(chǎn)品可以鑒定B.1.1.7型新冠病毒最新消息,國內(nèi)至少12家IVD企業(yè)已在第一時間成功研制出B.1.1.7型新冠病毒鑒定試劑盒!其中,凱普生物更是同時發(fā)布了兩款自主研發(fā)的試劑盒,稱可對該毒株進行鑒別診斷。圣湘生物科技股份有限公司第一時間組織科技攻關團隊研發(fā)快速新冠突變病毒鑒別檢測試劑盒,目前已成功研發(fā)出用于鑒別B.1.1.7新冠病毒株的核酸檢測試劑,試劑選取S基因中主要的突變位點,檢測引起親和力增強的突變位點N501Y,以及引起病毒可能逃避人體免疫的缺失突變位點HV 69–70del,進行鑒別檢測。該試劑可以實現(xiàn)1小時內(nèi)鑒別區(qū)分新突變毒株B.1.1.7和非突變毒株,同時該試劑可以搭配圣湘生物快速核酸檢測平臺,也可以搭配圣湘生物的全自動和半自動核酸提取平臺進行高通量的鑒別檢測。目前,廣東凱普生物科技股份有限公司自主研發(fā)的新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)以新型冠狀病毒ORF1ab 基因及編碼核衣殼蛋白 N 基因的特異性保守序列為靶區(qū)域進行擴增檢測。經(jīng)凱普香港檢驗所測序確認,該試劑盒可有效檢出包括B.1.1.7毒株在內(nèi)的絕大部分毒株。凱普新型冠狀病毒(2019-nCoV)核酸測定試劑盒(Sanger測序法)獲得國家發(fā)明專利(專利號:202010460533),并被廣州市科技局選定為應急攻關項目。該試劑盒能檢測覆蓋ORF1a、ORF1ab和4種結構蛋白:S、M、E、N基因的特定區(qū)域,并針對突變株新增了ORF1ab、spike、Orf8、N等4個基因的17個特定位點的檢測,既能檢測出突變毒株,亦能對新突變毒株B.1.1.7和非突變毒株進行鑒別診斷。目前,上海伯杰醫(yī)療科技有限公司針對英國突變株的核酸檢測試劑盒已經(jīng)研發(fā)成功,正處于充分驗證的過程中,即將上市。該試劑盒以在原產(chǎn)品基礎上增加分型結果的形式開發(fā),即首先通過伯杰新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒(熒光PCR法)判斷是否為新冠陽性,在此基礎上,通過本試劑盒檢測的N501Y和69-70del突變位點,判斷是否為B.1.1.7突變株。本試劑盒通過利用ARMS-PCR法對SNP檢測的原理,針對B.1.1.7突變株的S(Spike)基因上的重要突變位點N501Y和69-70del設計引物探針,使其可針對含上述突變位點的靶標產(chǎn)生熒光擴增信號,針對野生型靶標無熒光擴增信號,從而實現(xiàn)野生型病毒株和突變型病毒株的鑒別診斷。上海捷諾生物科技有限公司為助力應對新冠突變病毒對全球疫情防控帶來的影響,第一時間研發(fā)出可用于鑒別B.1.1.7新冠病毒株的核酸檢測試劑。該試劑盒對新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)的ORF1ab及N基因的特異性保守序列為靶標,用于檢測標本中新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)的RNA。采用等位基因特異性PCR(allele-specific PCR,ASPCR)實現(xiàn)野生型病毒株(501N)和突變型病毒株(501Y)的鑒別診斷。江蘇宏微特斯醫(yī)藥科技有限公司成功研發(fā)新型冠狀病毒B.1.1.7毒株(N501Y和P681H)快速鑒定試劑盒。本試劑盒用于新型冠狀病毒SARS-CoV-2 B.1.1.7株(N501Y和P681H)的快速鑒定,適用于新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)確診病例進一步進行B.1.1.7型主要突變位點N501Y和P681H的鑒別診斷。深圳華大基因股份有限公司控股子公司深圳華大因源醫(yī)藥科技有限公司宣布,公司研發(fā)了新型冠狀病毒SARS-CoV-2 B.1.1.7株(N501Y)快速鑒定試劑盒。華大因源稱,針對新型冠狀病毒檢測陽性的病例,可進一步進行B.1.1.7型主要突變位點N501Y的快速鑒別診斷,一個小時內(nèi)完成。據(jù)介紹,該試劑盒采用ARMS-qPCR方法,針對英國B.1.1.7株核心突變位點N501Y設計特異性擴增,結合熒光探針信號,快速識別野生型和突變型病毒株,可實現(xiàn)野生型病毒株(501N)和突變型病毒株(501Y)的鑒別診斷。廈門大學分子診斷教育部工程研究中心團隊聯(lián)合廈門致善生物科技股份有限公司,利用擁有自主知識產(chǎn)權的“多色探針熔解曲線分析”(MMCA®)技術,開發(fā)出“B.1.1.7型新冠病毒鑒定試劑盒”,根據(jù)熔點組合可精確鑒定出新冠病毒B.1.1.7變異型。該試劑盒適用于新冠病毒核酸陽性樣本的快速鑒定,可區(qū)分B.1.1.7新冠疾毒毒株和非B.1.1.7新冠病毒毒株。該試劑盒一步操作,時間短,炅敏度高,并可靈活用于不同場景。根據(jù)樣本多少,致善生物提供了兩個鑒定方案:一體機檢測方案和批量檢測方案,分別用于即時檢測和批量篩査。杭州優(yōu)思達生物技術有限公司基于成熟的、自主專利的POCT核酸一體化分析平臺,在第一時間內(nèi)利用CPA恒溫擴增技術及一體化檢測管的核酸分析技術成功開發(fā)新型冠狀病毒通用型/B.1.1.7突變型核酸檢測試劑盒(恒溫擴增-實時熒光法),每個檢測管具有兩個獨立的反應腔室,其中一個反應腔室特異性擴增并檢測新冠ORF1ab與N基因上的靶序列;另一個反應腔室檢測高傳染性毒株B.1.1.7 序列S基因上引起其高傳染性的N501Y突變和HV 69-70缺失。實現(xiàn)了在密閉的檢測管中自動完成核酸提取和核酸擴增檢測的全部流程,達到樣本進、結果出的檢測效果,1小時內(nèi)出報告,快速對新冠病毒通用型和B.1.1.7突變型作出鑒定。萬孚生物第一時間組織科技攻關團隊快速研發(fā)新冠突變病毒鑒別檢測試劑盒,目前已成功研發(fā)出用于鑒別新型冠狀病毒 B.1.1.7突變毒株的核酸檢測試劑盒,試劑選取S基因中的主要突變位點 N501Y和缺失突變位點 HV 69-70del,進行鑒別檢測。東方生物公司及時跟蹤新冠病毒變異、繼續(xù)加快檢測試劑迭代、滿足多種檢測需求,現(xiàn)又成功研發(fā)了用于鑒別診斷英國和南非新冠變異毒株的核酸檢測試劑盒,分別為新型冠狀病毒N501Y和HV69-70del基因突變檢測試劑盒(熒光PCR法)、新型冠狀病毒K417N和 E484K基因突變檢測試劑盒(熒光PCR法),將繼續(xù)投入國際抗疫一線。為應對新冠突變病毒對全球疫情防控帶來的影響,碩世生物第一時間組織研發(fā)團隊迅速開發(fā)新冠突變病毒鑒別檢測試劑盒,目前已成功研發(fā)出用于鑒別B.1.1.7與B.1.351新冠病毒突變株的核酸檢測試劑,試劑盒采用ARMS法(擴增受阻突變系統(tǒng))選取S基因中主要的突變位點,檢測引起親和力增強的突變位點N501Y,S蛋白與人ACE2受體結合親和力提高位點P681H以及引起病毒可能逃避人體免疫的缺失突變位點69–70del,探針采用不同熒光進行標記,一次檢測三種突變,熒光PCR儀根據(jù)突變型和野生型反應CT值的差異(∆Ct)實現(xiàn)對突變株的檢測。中元匯吉已成功推出B.1.1.7型新冠病毒鑒定試劑盒,試劑盒選取新冠病毒S基因中與傳染性增強相關的錯義突變位點N501Y以及缺失突變位點HV 69-70del,進行鑒別檢測。B.1.1.7型新冠病毒鑒定試劑盒可搭配中元匯吉快速核酸提取試劑盒、全自動核酸提取儀EXM6000實現(xiàn)最快12分鐘完成96樣本的核酸提取,1小時出結果。檢測抗體為識別N蛋白和S蛋白的抗體。N 蛋白比較保守,且含量相對較多。根據(jù)文獻報道,一個冠狀病毒粒子僅含有1條RNA,而其S1蛋白與N蛋白的平均含量則為含有222分子和3000多分子。關注靈敏度的影響。雖然S蛋白上突變暫時并未發(fā)現(xiàn)其導致抗原一級序列重大變化,這就意味著理論上抗原表位(線性表位)不會發(fā)生變化,抗體可以正常識別。但是一級序列會導致二級結構,最終影響三維結構,最后導致同抗體結合的變化,這也是病毒逃逸體液免疫最常用手法,沒有之一。免疫診斷試劑的有效性在于抗原和抗體的結合的特異性,親和力。目前各個廠家都選擇S蛋白和N蛋白用于抗體檢測,同樣的也是因為S蛋白為表面主要抗原蛋白,N蛋白更為保守,采用間接法檢測。機體感染病毒后,會產(chǎn)生各種各樣的抗體,包括不同類型抗體和識別不同表位的抗體。不受影響的情況,引物、探針設計序列完美的避開S基因突變位置;反之亦反。相信不會出現(xiàn)完全脫靶的情況,要不然真的中大獎嘍。按照國際、國家標準,試劑盒中的引物至少要識別兩種不同基因,盡可能減少假陰性。但敬請額外關注新冠突變情況,至少目前我國對于新冠的篩檢還是以核酸檢測為主。也許現(xiàn)在核酸檢測試劑盒的引物沒有脫靶,但是這將一直需要格外的關注。能夠準確檢測包含但不限于新冠突變株B.1.1.7的試劑盒才是好的、大家需要的。

突變毒株鑒定試劑盒推出,這個市場熱點的出現(xiàn)是比較超乎想象的快,至少12家企業(yè)官宣突變病毒株鑒定試劑盒研發(fā)完成。新冠教會了大家更快的去捕捉新的市場熱點,更好進行市場運作。從流行病學的角度考慮,是需要及時了解新突變病毒株的流行情況;可是,突變會一直存在,而且很可能很快就會出現(xiàn)新的突變進化毒株。恐怕這就要較量試劑盒的研發(fā)上市速度和新冠變異速度。隨著感染人群不斷擴大,病毒每傳播一次,就會遭受免疫系統(tǒng)的洗禮一次。比起流感,新冠的變異真的太正常不過,大家還是要平常心,更科學客觀的看。對于病毒突變的監(jiān)控,相信所有的疾控專家們都在密切的監(jiān)測中。臨床應用,可能更需要考慮存在的意義。目前,并沒有看到新的突變導致致病性增高,因為病毒的復制性和致病性有相關性但是非絕對相關性。相信所有人都會從這場沒有硝煙的戰(zhàn)爭中學到很多,得與失、沉與浮,相信很快就會有了答案。防疫之路依然漫長!日常防護,戴口罩、勤洗手、保持一定社交距離,依然是必不可少的!